Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms