Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN25C9JDP6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN25C9JDP6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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