Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms