Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3BA8MYP8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms