Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA8JA6NMD2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA8JA6NMD2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA8JA6NMD2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA8JA6NMD2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA8JA6NMD2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA8JA6NMD2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA8JA6NMD2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA8JA6NMD2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA8JA6NMD2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA8JA6NMD2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms