Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX1

FAM223B, Protein FAM223B, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM223BA6NKX1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms