Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms