Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms