Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms