Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARFGEF1Q9Y6D6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGEF1Q9Y6D6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGEF1Q9Y6D6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGEF1Q9Y6D6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGEF1Q9Y6D6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGEF1Q9Y6D6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGEF1Q9Y6D6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGEF1Q9Y6D6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGEF1Q9Y6D6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGEF1Q9Y6D6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGEF1Q9Y6D6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGEF1Q9Y6D6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGEF1Q9Y6D6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGEF1Q9Y6D6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGEF1Q9Y6D6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGEF1Q9Y6D6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms