Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX11Q9Y5W9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX11Q9Y5W9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX11Q9Y5W9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX11Q9Y5W9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX11Q9Y5W9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX11Q9Y5W9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX11Q9Y5W9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX11Q9Y5W9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX11Q9Y5W9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX11Q9Y5W9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX11Q9Y5W9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX11Q9Y5W9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX11Q9Y5W9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms