Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms