Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms