Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
THRAP3Q9Y2W1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THRAP3Q9Y2W1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms