Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD1AQ9Y241 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms