Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC6Q9Y210 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms