Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms