Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AMFRQ9UKV5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms