Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN16Q9UKR8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms