Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms