Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH22Q9UJ99 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH22Q9UJ99 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms