Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms