Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP25Q9UHP3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms