Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFMBT1Q9UHJ3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms