Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms