Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms