Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRIM10Q9UDY6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM10Q9UDY6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM10Q9UDY6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM10Q9UDY6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM10Q9UDY6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms