Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJB4Q9UDY4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms