Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NXF1Q9UBU9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms