Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms