Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms