Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ORC3Q9UBD5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms