Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCMF1Q9P0J7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms