Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GGA3Q9NZ52 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms