Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms