Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CWC25Q9NXE8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms