Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms