Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO28Q9NVF7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms