Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MED17Q9NVC6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MED17Q9NVC6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MED17Q9NVC6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MED17Q9NVC6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MED17Q9NVC6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MED17Q9NVC6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MED17Q9NVC6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MED17Q9NVC6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms