Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IMP3Q9NV31 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms