Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
PDS5BQ9NTI5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms