Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms