Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPHNQ9NQX3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPHNQ9NQX3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms