Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31BQ9NQW1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms