Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms