Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms