Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4BQ9NPR2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms