Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCQ7

NPVF, Pro-FMRFamide-related neuropeptide VF, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPVFQ9HCQ7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPVFQ9HCQ7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPVFQ9HCQ7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms