Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STN1Q9H668 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms