Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 AC013469.1-201ENST00000426985 403 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 AP000944.1-201ENST00000533886 564 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 AC034187.1-201ENST00000437047 561 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 AC008567.2-201ENST00000589751 656 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 NRXN1-234ENST00000630656 837 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 AL162385.1-201ENST00000451595 1202 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SENP3Q9H4L4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms